本发明公开一种双蛋白平衡乳酸菌饮料及其制备方法。它的原料由动、植物蛋白和大豆分离蛋白粉、双歧因子、乳酸菌及稳定剂、葡萄糖、柠檬酸等组成；制备方法包括：1)将全脂奶粉、大豆分离蛋白粉、葡萄糖等加水后乳化水合；2)在20MPa～50MPa压力条件下均质；3)将其杀菌后降温至50℃以下，接种发酵8h～14h；4)降温至10～30℃进行后发酵，增强产品风味；5)将白沙糖和稳定剂水合后与发酵酸奶混合；6)将花生、核桃、巴旦木混合，进行磨浆、过滤、再与5)中溶液搅拌混合；7)用柠檬酸水溶液调酸；8)加入营养强化剂和食用香料后，再进行均质即得到乳酸菌饮料。其生产工艺操作简单、成本较低；本饮料主要优点是“双蛋白的营养均衡”。